在PCR实验中,污染是一个常见且严重的问题,可能导致假阳性结果,影响实验的准确性和可靠性。为有效预防和处理PCR污染,需遵循以下注意事项:
一、实验分区与操作流程
合理划分实验区域:将实验分为标本处理区、PCR反应液制备区、PCR扩增区和产物分析区,各区域应有明确的隔离和方向性,避免交叉污染。
单向工作流程:从预PCR到后PCR,实行“单向"工作流程,确保在后PCR区域引入的耗材和防护装备不会未经消毒就回到预PCR区域。
试剂与样品分离:PCR试剂、PCR反应液应与样品及PCR产物分开保存,不应放于同一冰盒或冰箱。
二、试剂与材料准备
试剂分装:所有PCR试剂应在超净工作台或负压工作台配制和分装,使用专用加样器和吸头,避免交叉污染。
试剂储存:实验室自配的试剂(如去离子水、缓冲液等)在使用前应高压灭菌或过滤除菌。
试剂小量分装:PCR试剂应小量分装,以减少重复取样次数,并置于-20℃保存。
三、实验操作规范
正确佩戴防护装备:实验过程中应戴一次性手套,若不小心溅上反应液,立即更换手套。
避免气溶胶污染:操作时应勤换手套,进出不同区域或进行模板操作后应及时更换手套;开管动作要轻,以防管内液体溅出或形成气溶胶。
减少操作污染:在同时进行多个PCR反应时,应制备主反应混合液,再分装至PCR反应管,最后添加样品核酸模板,以减少单个添加操作繁琐造成的污染。
使用防溅污染的吸头:使用防溅污染的移液器吸头,减少样本或试剂中的气溶胶形成
四、污染监测与处理
设立对照实验:设立阴阳性对照和空白对照,监测反应体系各成分的污染情况,选择合适的对照样品。
污染识别:使用“无模板对照"(NTC),其中NTC孔包含所有qPCR反应组件,但不包含DNA模板。如果在NTC孔中观察到扩增,可能表明反应组件中存在污染。
污染处理:若发生污染,应设立阴阳性对照监测污染情况,排除试剂污染后,考虑环境污染的可能性,通过追踪实验查找污染源,必要时更换实验场所或重新设计引物。
五、实验室清洁与消毒
定期清洁:实验结束后对操作台面、仪器、实验用具及环境进行清洁,避免污染。
消毒措施:使用10-15%的漂白溶液(次氯酸钠)擦拭表面,让漂白剂作用于表面10至15分钟后,用去离子水擦拭,最后用70%酒精浸湿的纸巾快速干燥表面。
设备消毒:定期消毒用于准备qPCR反应的表面和设备,包括工作台面、移液器、冰箱/冷冻室把手、离心机、涡旋器和其他触点。
六、污染控制技术
UNG法:使用尿嘧啶糖苷酶(UNG)去除PCR产物中的污染,优点是能去除任何来源的污染,且UNG处理可与PCR扩增在同一反应管内进行
DNase I法:采用DNase I法处理反应液污染,适用于去除污染DNA。
固相捕获法:利用生物素标记的单链RNA探针与待扩核酸杂交,再用包被链霉亲和素的固相载体捕获杂交核酸,从而去除污染
七、其他注意事项
实验记录与验证:坚持常规清洁工作,设计阴性对照组,连续三天阴性对照没有起跳,则污染得到控制。
人员培训:所有操作人员应接受严格培训,确保操作规范,减少人为污染风险。
通过以上措施,可以有效预防和处理PCR污染,确保实验结果的准确性和可靠性。
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